осталась почему-то папка
Удаляется по красной кнопке, или командой только то, что было установлено изначально. Если в процессе работы плагинов в папке появляются другие файлы, например конфиги, или файлы скомпилированные в *.pyc, то они остаются вместе с папкой. Для этого предусмотрен postrm, где и прописывается обычно полное удаление папки плагина, как то так:
rm -rf /usr/lib/enigma2/python/Plugins/Extensions/папка_плагина/