Строку /usr/lib/enigma2/python/Plugins/Extensions/Transmission/transmission.sh start   добавить в  /usr/lib/enigma2/python/Plugins/Extensions/EMUmanager/emustarter.sh  59 строкой.
И для проверки полный ребут.

Как работает торрент, расскажите Нам?

likon, работать оно конечно будет. Я имею в виду transmission при перезагрузке. Только вот не место там абсолютно автозапуску сторонних программ. Пусть каждый занимается своим делом. По простой причине - при модификации-удалении-обновлении emustarter.sh тупо будет заменен новым, и потом ищи концы. Если нужна автозагрузка - то лучше запихать в rcS, хотя есть варианты еще лучше.

P.S. Не копай себе яму, критическое количество таких полу-решений уже близко. Поверь на слово сисадмину с 15-летним стажем.