Че-та вы там не то попрописывали. Вам же надо папки со всем их содержимым? Посему, для примера, не /var/emu , a    /var/emu/ и т.д.
 А вобще попробуйте прописать в файле вот как-то так:

# enter stuff you want to backup here.
# one file or directory per line
#
# /var/etc/rcS.local         # an example for a single file
# /var/tuxbox/config/tuxtxt/      # an example for a complete directory
/var/tuxbox/config/         # old default
/var/emu/
/var/keys/
/etc/init.d/cam
/lib/modules/2.6.32.57_stm24_0210/extra/pti/
#
А лишнее из него поубирайте.
Добавлено  10 октября | 2012г. | 21:54:38   
Пы.Сы  Основные настройки ( каналы там всякие и т.д.) именно в /var/tuxbox/config/  и содержатся.