Сколько людей - столько мнений. Что-то было в опенплишной теме что именно надо сделать дабы при обновлениях такие мелочи не трогались, вернее чтобы при обновлении не затирались данные которые устраивают вас но не устраивают разработчиков. Поищите там, тем более что это абсолютно неархитектурозависимо.