Вообще то это делается консоль-командой: tar xzvpf /tmp/xxxxxxxxx.tar.gz -C /
где xxxxxxxxx.tar.gz - это, собственно, название вашего tar- пакета, помещенного предварительно в папку tmp ресивера...
 Однако лучше (и проще) вообще проделать данную операцию вручную:
1. Остановка системы консоль-командой init 4
2. Удаление по FTP , подлежащих замене старых модулей.
3."Забрасывание" по FTP же аналогичных новых (с присвоением им соотв. атрибутов)
4. Консоль-команда init 6