У меня /dev/sda1 на диске fat32; /dev/sda3 ext2:

При тестах нужно учитывать, что хотя флешка это и не жесткий диск, но таки никто не гарантирует, что скорость записи/чтения из начальных адресов флеша будет такой же, как из "дальних" (китайцы любят подобные "оптимизации" - начальные адреса быстрые, а дальше - как повезет) - т.е для чистоты эксперимента лучше использовать только один раздел.

Интересует скорость доступа к ним.

Лично я бы больше смотрел не на "сырую" скорость чтения/записи, а на то, какая из ФС лучше (быстрее) справляется с ситуацией "прочитать содержимое каталога, в котором много мелких файлов".