Konditer, worch,
спасибо.
Все дело было в 4ae0.
В логах карта определялась как 4ae1, поэтому в конфиге так и указывал, потом вычитал, что должно быть 4ae0 для карт 52 серии.
Исправил в конфигах, но заработало только после того, как в раздел
[reader]
active = 1
type = tuxbox
name = cardreader
device = /dev/sci0
handle_pts = 1
debug = 1

добавил строку
force_caid = 4AE0