стали нули отображаться?
По моему вы излишнее внимание уделяете этим нолям. Ноли не есть плохо

Кстати, там что то в настройках энигмы есть по этому поводу.
Пробежался по своим спутникам, лично у меня у всех крупных провайдеров ноли, а у региональных как бы "правильно", у нтв+ ноли и только у ТНВ с 36Е "верно", но он не входит не в один пакет с 36Е, у Big Bang TV вперемешку, то есть тенденция ясна.
Поверьте, это ни на что особо не влияет. Пиконы с "не правильным" пространством имен в референсе прекрасно отображаются в скинах, но могут при этом не отображаться в некоторых плагинах, например в Raed QuickSignal, там свой конвертер.
То же самое с EPG. Мы как то спорили, но epgimport не доходит до пространства имен. Большинство региональных каналов "не заморачиваются" с референсами и каналы имеют sid = 1, ну и все остальное. Например у двух каналов с разных спутников референсы начинаются одинаково 1:0:1:1:1:1:..., а далее пространство имен отличается, формально референсы разные. А epgimport присвоит этим двум каналам одинаковую программу, мало того, программа будет того канала, который первый встретится в файле epg. Поэтому не верная программа часто встречается на таких каналах, правда сейчас их стало меньше и никто особо не сверяет, я раньше сверял.
Главное, чтобы референсы канала, пикона и в chanellist для EPG были одинаковы.