Подмена компонентов имиджа,никогда ни к чему хорошему не приведет,рано или

Ничего там сложного и страшного нет.
Все измененные дефолтные компоненты энигмы автор обозначает как *.old и оставляет в системе.
Их не более 5-7 штук если мне не изменяет память.
Когда (редко) приходят изменения сорцов энигмы при обновлении,и происходит GS,можно остановив энигму в консоли,просто снять пометку  *.old с каждого файла и обновиться повторно.Энигма тогда корректно обновится и можно ждать очередного обновления ExtraChannelSelection от автора на базе этих новых сорцов энигмы.
Кроме того ака Учкуном детально описан процесс временной деинсталляции плагина при изменении энигмы до выпуска им новой версии.
Думаю сам плагин стоит этих незначительных телодвижений.