maikl, Больше похоже что не хватает скорости записи у флешки.
Вообще флешки для записи HD каналов лучше выбирать из быстрых (по максимальной скорости записи)
Сделать тест скорости флешки можно в CrystalDiskMark22
Тут есть табличка с замерами скорости разных USB флешек
У меня флешка довольно шустрая, тормозов и рассыпаний нет.
Silicon Power Lux Mini 920 32ГБ отформатирована в EXT3
Sequential Read : 34.346 MB/s
Sequential Write :
27.425 MB/sRandom Read 512KB : 34.128 MB/s
Random Write 512KB :
21.430 MB/sRandom Read 4KB : 7.290 MB/s
Random Write 4KB : 1.585 MB/s