Не я один мог подумать, что при копировании папки usr может произойти замена файлов, как в любой операционке Windows.
Вот тут то как раз и вся соль, ресивер работает не на Windows, а на операционной системе Linux.
то проще все-таки установить все файлы по одному ручками
По одному ручками всё равно давать права файлам и папкам. В программе DCC по FTP соединению удобно менять сразу всем выделенным файлам или папкам права.