если удалять через "Удаление скинов" удаляются конверторы и рендеры которые могут использоватья кем угодно и скинами и плагинами
дело не только в рендерах, было у меня на 3.1 ,удалил руками папку VU_HD. а какой то плагин ,непомню точно какой брал оттуда картинки и поэтому закономерно зеленка