Yrriikk,
1. не касаясь последнего случая когда совершен переход на другое ядро, смена драйверов, позволяет пользоватся последней версией (исправление ошибок и дополненый функционал) на более старых имиджах, тое сть не заниматся переставление и настройкой
2. это в ftp клиенте обычно проверяются и выставляются права доступа к файлам( обычно просто файлы 644, папки 755, в системной области бывают и другие атрибуты но лазить туда не рекомендую пока четко не оснаеш чего делаеш)
3. максимально что получится это незапуск имиджа, лечится обычно возвратом назад стаых дров или перепршивкой имиджа
PS для подобных вопросов есть раздел , вопросы новичков....