закрыл (1-й файл) (сериала например) позиция сохранена, открыл файл другого сериала или фильма (2-й файл) закрыл его - позиция сохранена, вернулся назад в папку к 1-му файлу - позиция сброшена. Снова открыл и закрыл его, позиция во 2м сброшена
Удалите /home/root/resumepoints.pkl,правда это сбросит все сохраненные позиции и потестируйте еще.