сейчас специально у себя перепроверил, кроме костыля у всего 644

У меня с этим делом проще.
Мой TitanNit по-умолчанию всем файлам присваивает права 755, даже пиконам в папках:
Когда появился "костыль", как мы все помним, поначалу права 755 ему не присваивали, но я у себя заметил и об этом тут на форуме отписывался, что на этом имидже AU проходит буквально за пол минуты а на других гораздо дольше, особенно на E2.
Так что это информация к размышлению.