Насчет консоли не уловил суть вопроса, но я сделал так: в /etc/ в файл crontab добавил строку:
0 */3 * * *      root  /media/hdd/Slot1MBBackup.py
которая каждые три часа запускает файл Slot1MBBackup.py (это у меня резервное копирование настроек и критически важных файлов)  с флешки.
а так:
0 */3 * * *      root  /media/hdd/MyBackup
тоже самое, но файл исполняемый и скомпилированный под arm
Думаю с запуском скрипта *.sh тоже проблем не должно быть.