Смена загрузчика и ПО некак не влияют на работу ресивера. Вот если Вы на компе вместо ХР установите Вин7 или Люнукс, как это повлияет на комп и на его работу? Да не как он работает как и работал.
А если поменять загрузчик когда установлено ПО от аналогов? Тоже некак просто ресивер будет видеть ту прошивку на флешке, от которой загрузчик установлен, другое ПО он не увидит. Но будет работать и перезагружатся как невчем небывало.