Вообще-то по умолчанию AU включён
С чего это вдруг?
Если auto_update не будет нигде не указан, то ничего АУкатся и не будет.
Проверить элементарно.
Если следовать вашей логике, то АУкалка включена всегда.
Тогда думаю, не составит Вам труда в ридер
[reader]
name = funcard
type = funcard
дописать строку
auto_update = 1
Ведь это же тоже самое, что Вы утверждаете
по умолчанию AU включён
Всё очень просто.
И сравните логи.
Появятся ЕММки в логе или нет?