Firstman, файловая система, к кракозябрам с кириллицей в именах, не имеет отношения - это несоответствие кодировок, используемых Windows (1251) и Linux (UTF-8). Если HDD установлен внутри ресивера, и закачка файлов осуществляется по FTP, либо по сети -  то при правильной настройке файлменеджера, никаких проблем не возникнет!!! Проги, типа FileZilla или Totall Commander от версии 7.5а при копировании, в обоих направлениях, перекодируют имена налету, так что пользователь этого не замечает! Для TC 7.5 в настройках FTP, надо включить поддержку UTF-8.
Если же копирование файлов делается прямым подключением HDD к компьютеру - то вернув HDD в тюнер, кракозябры будут обязательно. Поэтому установка харда внутрь предпочтительнее! Форматировать,  конечно только в родную ext - нет ограничения 4 Gb, как  и в NTFS